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Como el tema es largo trataré de resumirlo, fui reconocido por mi padre 2 dias antes de cumplir la mayoria de edad en Venezuela, esto fue inscrito en la partida de nacimiento venezolana a la semana de dicho acto
resumo
reconocimiento: 09/10/1996
Dieciocho años: 11/10/1996
Inscripción en partida de nacimiento 15/10/1996

Si he obtenido la nacionalidad española

¿Me puedo acoger al arti­culo 124 del código civil para anular los efectos de este acto?

A ver si te entiendo..... ¿pretenderi­as acogerte a la ley española con carácter retroactivo?
O sea, siendo ahora española, que se te aplique la ley española para anular un acto ocurrido antes de serlo..

Entiendo que no podri­as. En todo caso, podri­as haber hecho lo que la legislación venezolana permitiera.

Tu inscripción como española se hace en virtud de transcripción de la literal que presentas.
Si hay un error o algo que modificar, entonces primero hay que corregirlo o arreglarlo en el acta que se presenta, y luego eso ya se transcribe nuevamente al acta española.

La primera pregunta seri­a ¿qué nacionalidad teni­a tu padre cuando te reconoció?; como dices que se inscribió el reconocimiento en el registro venezolano entiendo que tu padre también lo era.

Luego poco importa para la ley española que fueras menor o mayor de edad cuando tu padre te reconoció porque no se te podi­a aplicar nuestra ley entonces, ya que el reconocimiento no afectaba a ningún ciudadano español.

Ahora, ya como español mayor de edad, entiendo que no te puedes acoger al arti­culo 124 del Código civil de ninguna manera.