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Tengo un cliente en mi despacho, que se ha separado de su pareja, no estaban casados.

La chica está embarazada y la relación ha acabado muy mal, con orden de alejamiento por en medio y me ha preguntado si puede ella reconocerlo en el hospital y después el padre acercarse al registro civil e iniciar un reconocimiento voluntario de paternidad...¿es eso posible?
¿cómo va el procedimiento?

Si el hospital está informatizado (los públicos suelen estarlo, la mayoría de privados no) podrá comunicarlo de forma telemática al registro civil de la localidad donde ha ocurrido el parto, o bien a la localidad donde reside ella en el caso de ser distinta, en el plazo de las 72 horas siguientes al nacimiento, siempre y cuando sea mayor de edad.

Si transcurren esas 72 horas, o bien el hospital dice que no puede remitirlo por cualquier motivo, deberá acudir ella personalmente al registro civil donde quiera inscribirlo (el del nacimiento o el de su domicilio, si no son el mismo).

En éste será inscrito sólo con la filiación materna, y luego el supuesto padre podrá ir a reconocerlo en cualquier momento, él solo. Acto seguido el registro civil llamará a la madre para notificarle ese reconocimiento paterno y que manifieste si está conforme o no.

o sea que la madre lo registra primero, y después el padre o supuesto padre se acerca al registro civil a reconocerlo y se lo comunican a la madre si mal no entiendo?

Sí, has entendido perfectamente.

Y si en la oficina del registro civil a alguien se le ocurre decir que deben ir ambos para hacer el reconocimiento, al mismo tiempo, dudo mucho que se haya leído lo que dice la legislación al respecto.

Pero eso ya es harina de otro costal.